從實用性和成本控製方麵來說，槽式發酵係統是有機肥生產企業的首選工藝。這裏作一下比較發現，自走式翻堆機機動靈活，但占地麵積較大；發酵罐發酵周期短，但代價高昂並非適合大眾化需求。目前應用較為廣泛的為槽式翻堆機，高檔次的有雙螺旋式翻堆機和鏈板式翻堆機等等，產品種類眾多，可根據自身需求定購。
利用太陽能進行好氧發酵是有機肥料生產過程中相當重要的一個環節。在這期間，有機固體廢棄物的處理必須解決幹燥、發酵、滅菌、除臭等問題，並最終以較低的成本獲取較高的經濟收益。在發酵之前，通過將各種待發酵的原料按照一定的比例進行混合，從而滿足水分、碳氮比等發酵條件，最終實現縮短發酵周期的目的，達到最理想的發酵效果。
為了把有機固體廢棄物製成高效有機肥，必須將其進行充分的發酵腐熟。因為沒有經過發酵或者發酵不徹底的有機固體廢棄物施用到土地裏對農作物是極其有害的，它在土壤中可分解產生熱量以及碳酸氣體等有害物質，嚴重影響作物的發芽及作物根係的生長。而有機固體廢棄物充分發酵後卻能達到消除有害物質，消滅病菌，減少臭氣的目的，同時也減小了占地空間，使腐殖質均勻地增加，施肥時用起來更加地方便。充分發酵腐熟是提高有機肥料中的有效成分腐殖酸的必要過程，而不經過該步驟處理的有機原料直接加入無機肥料所製成的有機無機複混肥料，盡管有機碳能達標，但因腐殖酸含量低對農作物及土壤不利。
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